早崎內湖面積約92公頃，在1963年到1970年間開墾成為農地，內湖已消失殆盡。相關研究團隊在開墾的農地上進行集水試驗後，魚類及鳥類都明顯地增加。縣廳琵琶湖政策課表示，「早崎內湖的再生計畫，可恢復生態系的生物多樣性，希望這樣的經驗及成果也可應用於其他內湖的復育再生。」
為復甦早崎內湖維持琵琶湖生態系的作用，縣政府於2001年開始進行自然再生的試驗。租借了早崎內湖所在的琵琶湖畔農地約20公頃，把水溢注進去。從2007年開始，在和試驗區中東西流向的丁野木川之間建造閘門，讓琵琶湖的魚可以在河流裡來回游動。
2011年的調查發現，魚類有19種，是自試驗開始以來最多的一次。日本原生種魚類有16種，其中個體數量最多的是鯽魚，有794尾，也有看到麥穗魚及青鱂魚。外來種曼波魚有2條，已防範其再入侵試驗區。
鳥類種類也逐年增加，2011年調查有84種，也是新高，而且還確認有鸊鷉幼鳥。小天鵝也群聚於此，縣政府認為「這裡的水面比琵琶湖穩定，已經變成適合水鳥棲息的環境。」並表示「如果中央的補助金發放下來，今年也會進行生態調查。」
縣政府預定在2013年底之前完成土地購買。從今年開始的5年內，將整治再生區域週邊的堤防，以完成早崎內湖復育再生的目標。
參考資料
※同步刊載於台灣溼地網 http://wetland.e-info.org.tw
- 京都新聞（2013年5月6日），早崎内湖の用地買収へ 本年度、県「生態系復活つながる」