行政院農業委員會上週表示，5萬公頃2期連休的耕地，將於102年起，從現行2期每公頃各補貼新台幣4.5萬元，改為只補助1期，另1期改為每公頃核發每月2000元離農津貼，6個月共發1.2萬元，促使地主以市價每公頃租金2萬元釋出予人承租，活化耕地使用，以增加收入。
此舉引起學者及農民質疑，不能只用少補助 1期來促使農民出租農地增加收入，應由農政系統完成所有農地調查，並親自執行承辦租地作業。
農民楊儒門並說，彰化以南農地常發生出租後被盜挖土壤、沙石及回填廢棄土的「一魚三吃」慘事，所以農民不敢出租土地，不只是錢的問題；政府要活化休耕地，應承辦出租作業，並引入檢調，以確保相關不法情事不要發生，消除農民的恐懼。
陳保基說，已經展開農地調查，了解 2期休耕地的地主及位置與面積，過去資料顯示台南市最大，有 1萬多公頃，桃園縣次之，約7000到8000公頃；相關休耕地調查作業以及整個政策，預計10月底可將休耕地活化政策送行政院，並完成審查。