9月下旬，雲林環保團體發現，台電公司竟然在幽情谷違法開路，準備遷移水庫淹沒區的電塔，幽情谷面臨一場空前的浩劫。混濁的溪水中，看不到以往成千上萬的蝌蚪，水中的魚蝦被掩蓋在土石之下，而在山壁上，法律明定要保護的稀有植物「圓葉布勒德藤」，有的僥倖逃過怪手的魔爪，往年都有八色鳥築巢紀錄的地點，這次也無法倖免於難。陳清圳認為，環保署要嚴格把關，保育措施做不到，就要退回。
這次違法開路，是水利署還是台電的責任，10月13日，立委尹伶瑛召集環保署、水利署、林務局以及台電公司到現場會勘，這片土地現在是水利署中區水資源局所有，但是任何的開發行為，仍然受到環評法跟森林法的約束。森林法明定應報經主管機關並會同有關機關，實地勘查、同意後才能施工，主管機關是林務局還是水利署中水局，雙方看法不同，開路的責任由誰負責還要釐清，而環保團體也已經展開法律行動，到雲林地檢署按鈴控告水利署中水局以及台電公司。
水利署長陳伸賢強調，湖山水庫可取代雲林民生用水抽取地下水，也把枯水期工業調撥農業用水還給農業，農業就不用抽地下水，湖山水庫每年約有一億噸的水可以取代抽取地下水，對地層下陷有實際幫助。高雄教師會生態教育中心主任李根政認為，今年年底，林內淨水廠開始運作，集集攔河堰每天要提供20萬噸的水給淨水廠，就可以替代雲林民生用水抽取地下水的情形，在沒有新增加的用水量，湖山水庫拿來供應原本抽取的地下水才有幫助，現在是要給六輕以及大煉鋼廠等新的水資源需求，對地層下陷幫助有限。
斷層離湖山水庫壩址只有1.8公里，當地地質又脆弱，即使水利署對水庫安全信心滿滿，當地居民對崩壩的恐懼始終存在。湖山水庫是雲林民眾不得不承受的風險嗎？從事地下水研究的中研院地科所汪中和老師認為，從成本效益分析，以及對社會、環境的衝擊來看，它並不是最理想的水資源開發方式，採用地下攔河堰或是伏流水的開發，都是成本低、破壞小、效益高的方式。汪中和老師強調，國家發展是要經濟成長，但是在雲林地區，地層下陷的損失已經相當嚴重，療傷止痛是最優先的方式。地面水要優先供應民生與農漁業使用，工業用水量龐大，而且工業有能力負擔比較高昂的設施跟水價，地層下陷的問題不優先處理，工業所帶來的經濟效益，無法彌補地層下陷的損失。
