高鐵沿線3公里公有水井封移計畫已經完成，雲林高鐵沿線下陷情勢已有所改善，經濟部水利署表示，將與高鐵局進一步持續嚴密監控！
行政院農業委員會及經濟部鑒於雲林地區地層下陷對高鐵行車安全潛藏的危害，於2005年提出辦理「雲林縣境高鐵沿線3公里寬範圍內公有合法水井封移實施計畫」，專案計畫在去年結束，針對高鐵沿線3公里範圍內的87口公有水井，已經完成封填水井29口、停用39口，加強監控19口。
由高程檢測資料顯示，去年雲林大部分地區下陷速率已低於7公分，持續下陷面積為581平方公里，相較於計畫執行前最大年平均下陷速率每年11.6公分，持續下陷面積679平方公里，顯然計畫實施地區在計畫執行後，地層下陷現象已呈現持續趨緩。
目前水利署除了持續進行加強地下水觀測與地層下陷檢測作業之外，並持續監控公有水井抽水狀況，也請雲林縣政府本於主管機關權責，加強違法水井處置，減緩地層下陷。