不過，環保及貿易團體還是把它公開了，他們說「要讓全世界都涉入這場攸關我們食品未來的爭議。」 這些團體譴責WTO的保密心態，並呼籲各國政府確保由合格的團體針對健康與環境等複雜議題以透明而公開的方式進行決策。
歐洲「地球之友」組織貿易協調員華戴爾表示：「WTO將裁決草案保密，這種做法道盡了的WTO所有的缺失：秘密、不民主且偏袒商業利益。WTO應該最沒有資格決定人們吃些什麼，田裡種些什麼。」
WTO小組裁決內容指出，歐盟並未遵守「食品安全檢驗與動植物防疫檢疫措施協定」(即所謂的SPS協定) 所規範的義務。該協定的目標為預防各國政府以衛生措施為名目，保護國內工業與外國競爭。
根據WTO小組裁決內容，「在1999年6月至2003年8月間，也就是該小組成立之時，歐洲共同體對基改產品實施貿易禁令。」到2003年，歐盟則制定管理架構以管控基因改造食品及飼料的進口。
環保與貿易團體稱WTO的初步裁決為「大開倒車」，因為「在具有科學不確定性情況下，國家與地方政府有權制定自己的環保與衛生規範。」
美國農業與貿易政策研究所資深貿易助理蘇潘表示：「WTO爭端解決小組的設立目的，是要在一個以促進貿易為目標的架構下嚴格檢視相關規範，而不是要實現公共或環境健康目標。」