日本「朝日新聞」報導，專家發現東京灣有台灣種文蛤，這是東京灣首度發現外來種文蛤。日本專家擔憂台灣種可能搶下東京原生種文蛤生存地，也擔心台灣文蛤與東京原生種雜交。
專家在日本、南韓、中國大陸、台灣共12處採文蛤細胞內的粒腺體DNA調查，結果得知東京灣葛西海濱公園的人工海濱估計62個文蛤當中就有6個是台灣種。山川表示，基因差異這麼大，需200萬年以上的時間，研判應該是台灣的原生種文蛤。
日本文蛤因沙灘人工填海、造堤防等因素而銳減，被日本環境省2012年列為有瀕臨絕種危險2類名單。因台灣養殖文蛤的技術好，日本千葉縣漁業協同組合連合會（漁會）2006年起將熊本縣產的文蛤拿到台灣繁殖，再引進日本，放流到千葉縣更津市外海等地。
山川說，台灣種文蛤一旦「定居」下來，就很難驅除，簡易的DNA檢驗1個花費不到1000日圓（約新台幣290元），至少應做好抽樣檢驗等制度。