龍江河水質超標事件污染源初步查明，禍首來自廣西金河礦業公司。目前，這家每月銷售收入達1億5000萬元的國有企業已被勒令停產。然而，21噸如此龐大的污染團突然出現，是因為一兩家企業大規模排污造成，還是當地日常普遍偷排累積達到爆發點，這是一直沒有得到解答的謎團。隨後事態發展卻是一波三折。
不過，金河公司大呼「冤枉」，副總經理李孟凡堅稱，「即使我們渣場中所有的鎘都滲入龍江，也不足以造成如此規模的污染。」李孟凡稱，該公司於2011年10月通過環保廳的清潔生產審核驗收。
由於當地地形複雜，地下溶洞較多，企業排污易透過地下溶洞進入河中，專家取證非常困難。中科院院士袁道先曾於1960年代對河池的喀斯特地形實地勘測，「拉浪水庫下面就有一條地下河。」在整個廣西的岩溶地區，這樣的地下河有幾百條。「這意味著如果是通過地下河造成的污染，源頭有可能在數十公里之外。」