為了讓良田不再消失，農委會10月中旬發布行政解釋令，指稱集村興建農舍不得位於特定農業區；也就是申請中、和尚未申請的集村農舍，全都因農委會的命令而喊卡。由於新竹縣有多個集村農舍因此胎死腹中，引起業者和已申購農地的消費者反彈，齊聚到新竹縣政府陳情。
新竹縣是目前全國集村農舍最多的縣市，佔了全國47%，由於集村農舍的土地價格成本，比一般的建地或是商業區土地便宜許多，因此集村農舍的建案，也深受薪水階級和竹科人的喜愛，往往建案還沒推出就被搶購一空。
在農委會10月中旬發布解釋令前，新竹縣政府依法一共核發40件集村農舍案件，在接到農委會的解釋函後，縣政府目前也必須依法不再受理民眾申請。200多位民眾前往向縣長邱鏡淳陳情，希望能代為向中央反映，希望中央能訂出集村農舍的落日條款，在100年7月1日以後再實施。陳情民眾也揚言，如果農委會沒有善意具體回應，將串聯到農委會抗議陳情。