2009年8月莫拉克風災造成台灣南部部分水庫大量泥沙淤積，加上雨量偏低，用水拉警報。經濟部水利署表示，包括高雄美濃水庫以及高屏大湖等興建案早已通過環評，但卻因為地方反對聲浪遲遲無法動工；以當前的狀況來看，除了極推動節約用水外，水利署也打算從地下水增量、工業回收水再利用等方面，尋找新水源。
想建水庫卻有執行困難，現在主管機關只能轉個彎思考。水利署已提出包括地下水增量、工業回收水再利用等因應措施。水利署長楊偉甫表示，「現在已經有缺水危機，未來我們需要有穩定水源，才能確保供水不會產生問題。總統也贊成這些都拿出來檢討，看看哪一個選項比較好，從技術上觀點是好的，拿出來討論，得到民眾跟立院支持，再繼續推動。」
水利署積極尋覓新水源的同時，也強調外傳的「美濃水庫復建」只是選項之一，並不會優先考慮。目前水利署已針對美濃水庫及高屏大湖等方案進行評估，短期內會向行政院提出報告。