台北市政府產業發展局委託中華民國溪流環境協會進行「北市生物多樣性指標調查計畫」，更首創「台北市生物多樣性資料庫」，包括鳥類、蝴蝶、蜻蜓、魚類、兩棲類、爬蟲類、原生植物等，民眾只要上網就可查詢北市生物的資料。
根據3年調查及記錄，淡水河系共有25種淡水魚類；蛙類則以木柵貓空地區種類最多，金面山區的蝴蝶物種豐富度最高，蜻蜓則以陽明山鹿角坑溪數量最多。
「台北市生物多樣性資料庫」已上線開放瀏覽、查詢，網址是http://www.biodiv.ed.taipei.gov.tw，除可查詢各種生物的基本資料及習性，還可以透過圖示了解生物分布的區域，未來更計畫開放民眾將自已觀察到生物登陸到資料庫中。