科學家暨環境學家巴葛羅 (Jaime Incer Barquero)表示：「82年來我們讓中美洲最大的湖變成世界最大的便池。這些年來每天我們倒入上噸的排泄物和垃圾，現在要救回它得花50年或更久。」
不過他表示，位於馬拿瓜湖岸的新的珊地諾(Augusto C. Sandino)廢水處理廠，在2009年2月底甫上任廠長歐特卡(Daniel Ortega)的帶領下，是邁向淨水目標的一大步。
尼加拉瓜水源與廢水部(the Empresa Nicaragüense de Acueductos y Alcantarillados)部長海耶娜(Ruth Selma Herrera)表示，新的廢水廠每天處理13.2萬公升廢水，未來更可以達到18萬公升的廢水處理量。
自1927年起，尼國政府下令至新的排水系竣工前，所有來自60家化學工廠與120萬居民的廢水均由17條支流排放至馬拿瓜湖內。然而直到2007年，連至廢水處理廠的32公里長排水管才終於完工。
廢水處理廠於1997開始興建，由美洲開發營行(the Inter-American Development Bank，IDB)、德國與其他歐洲國家政府、以及尼加拉瓜財政部共同資助，總耗資855億元。
現在連接至處理廠的排水系統共有超過12萬的使用者，這將改善汙染物排入位於尼加拉瓜西部，近太平洋的1040平方公里大的馬拿瓜湖。
海耶娜宣布將建造另一個排水網絡來連接Ticuantepe和Veracruz行政區以及首都南方更遠的地區到廢水處理廠。
2006年，拉丁美洲法庭 (1998年興建的民族法庭) 發現尼加拉瓜准許採礦工業污染流至加勒比海的San Juan河，忽視水源問題並持續使之惡化。
尼加拉瓜副總統馬洛斯(Jaime Morales)表示，清理馬拿瓜湖的計畫將向千禧年發展目標(the Millennium Development Goals ，MDGs)的承諾又大大跨了一步。在2015年前，尼加拉瓜將提供淨水與設備給至少250萬居民，以達到2000年國際會議所認同之 千禧年發展目標中水源可飲用的目標。