近年有不肖店家用較便宜的進口越南蚵冒充台灣蚵，但兩者口感有差別嗎？農業部水產試驗所（水試所）與國立台灣海洋大學以科技分析國產牡蠣的游離胺基酸、呈味核苷酸及肝醣等風味物質，證實台灣蚵比越南蚵更鮮更甜，味道更濃郁。
台灣蚵與越南蚵同屬葡萄牙牡蠣（學名︰Magallana angulata），售價較低的越南蚵，佔總進口牡蠣量一半以上。有商家看準市場對蚵仔需求而混充，不只造成台灣蚵戶損失，更可能有食安風險。
事實上，兩地的牡蠣因生長環境條件不同，孕育出不同風味。水試所於2日發新聞稿稱，與海洋大學透過氣相層析質譜儀（GC-MS）與液相層析儀（HPLC）等科學儀器，分析國產與越南牡蠣，發現台灣蚵在總呈味、鮮味及甜味胺基酸的表現上，絕大部分時間略高於越南蚵；肝醣可以賦予牡蠣濃郁的口感，3～9月正值產季的台灣蚵，在肝醣含量上亦顯著高於境外蚵。
水試所續稱，台灣蚵帶點淡淡的蘑菇與青草香，透過蚵仔煎、蚵嗲等傳統飲食技藝加持，更能展現台灣蚵的獨特性；與進口蚵相比，不僅碳足跡短、新鮮度佳，也更符合台灣消費者的飲食期待。不過水產加工組組長蔡慧君稱，這次研究並沒有具體分析台灣與境外水域環境條件如何影響其風味物質。
目前台灣牡蠣業產值高達41億元，關係到2～4萬人生計，但絕大多數台灣蚵是以天然附苗方式養殖，漁民看天吃飯。農業部長陳駿季在5月19日立法院經濟委員會接受質詢時說明，每年台灣蚵消費需求約2～2.22萬噸，過去幾年因天然災害，導致國內產量下降，2019年開始越南蚵進口量亦隨之增加。
陳駿季續稱，水試所已成功開發人工附苗，雲林養蚵相關協會亦進駐學習技術，養殖成本從每台斤40元降至29元；亦會在雲林、嘉義、台南等地找試辦區，讓其他漁民可跟進，藉以降低養殖成本及穩定產量。