褐樹蛙廣泛分佈於台灣的中低海拔的山區，平時喜歡棲息在河邊的樹上或石縫中，但到了繁殖季節，則會大量遷移到溪流裏。繁殖期為夏季5月到8月。繁殖時期，白天仍在溪邊的樹上或石縫休息，黃昏的時候，才一隻一隻的跳到岸邊水流較緩的地方進行生殖活動。雄蛙經常聚成小群在石頭上鳴叫，叫聲是細碎的「嘓-嘓-嘓-」，偶而發出幾聲粗粗的「嘎」。
雌蛙體型很大，比雄性體型大很多。產卵前，雌蛙會先伸腿交互踢幾下，然後產一小團卵粒，雄蛙也會配合雌蛙動作伸長身體，然後再排精以提高授精率。卵小型，每次產卵300～400粒，卵一粒粒分離黏在石頭底下，通常聚成一堆。蝌蚪出現於溪邊水流較緩的地方，身體褐色，尾部有大型黑斑或條紋，為底棲性，常吸附在石頭上。
