六輕工業區排放的致癌物、揮發性有機物VOCs，汙染量該怎麼計算？環保署環評大會在審查4.7期擴建案時認為，除了製程本身的排放，也要把油漆塗佈、冷卻水塔等五項排放量，全都計算進來，並附帶寫進結論裡。不過六輕不服向行政院提出訴願，行政院將這條結論撤銷，訴願成功。但環保團體不放棄，再提行政訴訟，最後最高行政法院維持一審判決，不得單獨撤銷這項結論。
最高行政法院認為揮發性有機物VOCs、排放量的計算方式，是屬於「行政處分不可切割之一部」，不能單獨撤銷，另外最高行政法院更引用憲法、環境基本法，強調環境保護的價值。
面對訴願被撤銷定讞，台塑石化董事長陳寶郎表示等收到判決書才能表示意見。而環保團體不滿，六輕排放揮發性有機物是事實，對居民來說，不管是製程中排放，或是塗油漆時產生的，汙染就是會傷害健康、無法切割，也很欣慰最高行政法院的判決，是站在保障居民健康的這一邊。