廣東沿岸的海洋生態環境，為過去三十年的高速經濟發展付出了沉重代價。廣東省海洋與漁業局表示，珠三角沿岸海域去年的海水質量嚴重惡化，在污水都是未經處理就直接排入大海的情況下，62.9%的受監測入海排污口污水排放超標，其中廣州、東莞、中山三個地級市近岸海域幾乎全被嚴重污染。
廣東省政府前天公布《2009年廣東省海洋環境質量公報》，指出去年全省21.7%近岸海域海水屬輕度以上污染，11.2%近岸受中度或嚴重污染。全省近岸污染海域相當於香港全境面積的十倍，達10620平方公里，較07年增加了1310平方公里。其中，輕度污染海域面積為5150平方公里，比07年增加1580平方公里。珠江口以及粵西的湛江港，都是主要污染海域。
據分析，入海陸源污染物仍是我省海洋污染的主要來源，佔入海污染物總量的70%以上。而持續污染的結果，珠江口海域水體連續5年呈現嚴重富營養化狀態，90%以上的水域無機氮含量超過《海水水質標準》四類標準，部分生物體內鉛、鎘、砷、總汞和石油烴含量偏高，生物群落結構異常。