國立高雄海洋科技大學海洋環境工程系師生組成「鄉土環境汙染調查團隊」，常態追蹤監測後勁溪、愛河、前鎮河水質，藉數據揪出製造汙染的禍首。 最近團隊就指出後勁溪八涳橋到仁武橋段間，水中指標汙染物異常偏高，顯示有工廠違法排放汙染物，引起高雄縣市環保單位重視並追查；隔幾天再去採樣，揮發性有機化合物含量明顯降低。
調查團隊2006年以「高雄小港區黃金雨汙染原因鑑定」，獲得2006中華民國環境分析化學研討會的優良論文獎。當時小港地區深受從天而降的不明物質所苦，民眾質疑是大型工廠造成的汙染，醞釀抗爭，索取國賠。林啟燦說，團隊經過採樣，用質譜儀、氣相層析儀、電子顯微鏡分析，證實這些微小的黃金色點狀、管狀物，原來是蜜蜂的排泄物，地方抗爭才因此踩煞車。