據新疆省氣象中心表示，2006年6月以來，南北疆均出現大面積持續乾旱少雨天氣，氣溫偏高。6至8月，北疆氣溫均高於正常年份，降水則比往年減少30％以上，其中塔城地區遭遇32年最為嚴重的旱情，500多萬畝草場幾近荒蕪，不少牧區出現人畜飲水危機。
乾旱少雨及持續高溫天氣使新疆部分地州的河道來水少於往年，造成艾比湖等河流補給湖的水域面積縮減近60%。也導致阿勒泰地區春秋牧場生產力大幅下降，產草量比往年減少30％左右。據阿勒泰地委副書記扎坎‧海依沙表示，全地區的550萬頭牲畜2006年過冬將面臨巨大困難。